Protein–RNA interactions for Protein: H3BKF4

Gm20708, Predicted gene 20708, mousemouse

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Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20708H3BKF4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20708H3BKF4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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