Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms