Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms