Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms