Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms