Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gimd1E9PW74 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms