Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3002E9PW72 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms