Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms