Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms