Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms