Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uhrf1bp1B2KF50 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms