Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms