Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms