Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms