Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms