Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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