Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn15Q9Z0S5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms