Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.9 ms