Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Tnnt3Q9QZ47 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Tnnt3Q9QZ47 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Tnnt3Q9QZ47 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnnt3Q9QZ47 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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