Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms