Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms