Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms