Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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