Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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