Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc28a3Q9ERH8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Slc28a3Q9ERH8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Slc28a3Q9ERH8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Slc28a3Q9ERH8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc28a3Q9ERH8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms