Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Snap29Q9ERB0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms