Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc97Q9DBT3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms