Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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