Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rep15Q9D7T1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rep15Q9D7T1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rep15Q9D7T1 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rep15Q9D7T1 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rep15Q9D7T1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Rep15Q9D7T1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rep15Q9D7T1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rep15Q9D7T1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Rep15Q9D7T1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Rep15Q9D7T1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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