Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms