Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms