Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Trappc6bQ9D289 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Trappc6bQ9D289 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Trappc6bQ9D289 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Trappc6bQ9D289 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Trappc6bQ9D289 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Trappc6bQ9D289 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Trappc6bQ9D289 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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