Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms