Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Mrpl28Q9D1B9 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Mrpl28Q9D1B9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Mrpl28Q9D1B9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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