Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm12Q9D0R8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms