Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms