Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU9

Nup37, Nucleoporin Nup37, mousemouse

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup37Q9CWU9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nup37Q9CWU9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nup37Q9CWU9 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nup37Q9CWU9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nup37Q9CWU9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nup37Q9CWU9 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nup37Q9CWU9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nup37Q9CWU9 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Nup37Q9CWU9 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Nup37Q9CWU9 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Nup37Q9CWU9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Nup37Q9CWU9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Nup37Q9CWU9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Nup37Q9CWU9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Nup37Q9CWU9 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Nup37Q9CWU9 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Nup37Q9CWU9 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nup37Q9CWU9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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