Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Cnot11Q9CWN7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Cnot11Q9CWN7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Cnot11Q9CWN7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Cnot11Q9CWN7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Cnot11Q9CWN7 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Cnot11Q9CWN7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cnot11Q9CWN7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cnot11Q9CWN7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cnot11Q9CWN7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cnot11Q9CWN7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cnot11Q9CWN7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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Cnot11Q9CWN7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot11Q9CWN7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot11Q9CWN7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot11Q9CWN7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot11Q9CWN7 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot11Q9CWN7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot11Q9CWN7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot11Q9CWN7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot11Q9CWN7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot11Q9CWN7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot11Q9CWN7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot11Q9CWN7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot11Q9CWN7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot11Q9CWN7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cnot11Q9CWN7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cnot11Q9CWN7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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