Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pfdn1Q9CWM4 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pfdn1Q9CWM4 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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