Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Atxn3Q9CVD2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Atxn3Q9CVD2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Atxn3Q9CVD2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Atxn3Q9CVD2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Atxn3Q9CVD2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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