Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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