Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms