Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms