Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms