Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms