Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Nicn1Q9CQM0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Nicn1Q9CQM0 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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Nicn1Q9CQM0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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Nicn1Q9CQM0 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
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Nicn1Q9CQM0 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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