Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms