Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms