Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms