Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Brms1Q99N20 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Brms1Q99N20 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Brms1Q99N20 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Brms1Q99N20 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Brms1Q99N20 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Brms1Q99N20 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Brms1Q99N20 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Brms1Q99N20 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Brms1Q99N20 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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Brms1Q99N20 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms